Az élelmiszerlánc-felügyeleti díj arányos terhet ró az élelmiszerlánc-szereplőire, szemben az eddigi, a hús-szektort aránytalanul terhelő díjfizetési rendszerrel. Emellett a díjfizetést bevezető törvény termelőbarát. Mentesül ugyanis a felügyeleti díj bevallása és megfizetése alól az a mezőgazdasági kistermelő, akinek személyi jövedelemadó-köteles éves jövedelme nem haladja meg a 8 millió forintot. Az élelmiszerláncról és hatósági felügyeletéről szóló törvénnyel 2012 januárjától élelmiszerlánc-felügyeleti díjat kell fizetniük az élelmiszerágazat szereplőinek. A díjfizetésre kötelezettek május1-31 között regisztrálhatnak, a felügyeleti díjat bevallani május 31-éig, első részletét befizetni július 31-éig kell. A díj az élelmiszerlánc-felügyeleti szerv, a Nemzeti Élelmiszer-biztonsági Hivatal (NÉBIH) és a kormányhivatalok bevétele lesz és az élelmiszerlánc hatósági felügyeleti tevékenységgel összefüggő feladatok ellátását fedezi. A hatóságok évente 350 ezer ellenőrzést, illetve 1,5 millió vizsgálatot végeznek. Az Európai Unió több tagállamában is hasonló elvű általános díjfizetési kötelezettség terheli az élelmiszerlánc szereplőit. A felügyeleti díjfizetési és bevallási kötelezettség alá tartozik minden olyan élelmiszer- és takarmányipari vállalkozás, illetve élelmiszerlánc-szereplő, amelynek tevékenységére kiterjed az élelmiszerlánc-felügyeleti hatóság ellenőrző munkája.  A díj mértéke – bizonyos kedvezmények mellett – az érintett tevékenységből származó előző évi nettó árbevétel, illetve magánszemély esetén a jövedelem egy ezreléke. Az élelmiszerlánc-felügyeleti díjat bevallani május 31-éig kizárólag elektronikus úton, ügyfélkapus azonosítást követően a NÉBIH portálján kell. A díjat banki átutalással két részletben, egyenlő összegben, július 31-éig, illetve január 31-éig kell megfizetni a NÉBIH 10032000-00289782-30006016 számú elkülönített számlájára. A NÉBIH honlapján elérhető bevallási űrlapon a bevallóknak nyilatkozniuk kell arról, hogy mint élelmiszert kizárólag véső fogyasztók számára értékesítők jogosultak-e az egyszerűsített, átalányjellegű bevallásra és nyilvántartásra. A bevallási nyilatkozaton az elmúlt év élelmiszerlánc felügyelet alá eső tevékenységeinek nettó árbevételét, illetve magánszemélyek esetén jövedelmét, továbbá a jelenleg végzett tevékenység(eke)et, illetve a tevékenység végzésének jellemző helyét (megye) kell megadni. Az élelmiszerlánc felügyeleti díj bevallásával kapcsolatban további részletek a NÉBIH honlapján olvashatóak. Kérdések a felugyeletidij@nebih.gov.hu e-mail címre továbbíthatók, vagy a 06-1/336-9024-es telefonszámon tehetők fel. Az élelmiszerlánc szereplőinek teljes körű regisztrációs rendszerének kiépítése új eszköz lehet a feketegazdaság elleni küzdelemben.